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熱帯魚水槽用として市販されている光合成細菌による濾過は、多くの場合、一時的なものです。そのため、定期的に追加しなくてはなりませんが、やがて硝化細菌が殖えてきますと、今度は硝化細菌が濾過の主役になりますので、そうなれば光合成細菌の追加は必要なくなります。

熱帯魚水槽用として濾過バクテリアの素も市販されています。こうした濾過バクテリアの多くは光合成細菌と呼ばれる種類で、濾過器の中で活躍してくれる硝化細菌とは別の種類になりますが、硝化細菌が殖えるまでのつなぎとして有効です。